Este organismo encargado de crear la política pública de educación superior en Ecuador fue creada en 2010, tras el ofrecimiento del entonces presidente Rafael Correa. 

Correa había prometido que su administración estaría marcada por una nueva etapa en la educación superior como parte del cambio de la matriz productiva. Para octubre de 2010, como parte de la oferta, el Ejecutivo creó la Secretaría de Educación Superior, Ciencia, Tecnología e Innovación (Senescyt), a través de la Ley Orgánica de Educación Superior. 

Ese mismo mes, con el decreto 517, el gobierno fusionó a la ya extinta Secretaría Nacional de Ciencia y Tecnología (Senacyt) a la actual Senescyt junto con las obligaciones, competencias y funciones que cumplía aquella institución. 

Una de las primeras acciones de la recién creada Senescyt fue el cierre de 14 centros de educación superior. Estos centros, conocidos popularmente como “universidades de garaje” por las condiciones de sus instalaciones e infraestructura, fueron cerrados luego de un análisis de calidad que reflejó deficiencias profundas e irreparables que no permitían que su oferta estuviera acorde con la calidad que el gobierno esperaba. Una de las falencias más graves detectadas era que varias de esas instituciones otorgaban títulos de tercer nivel en tiempo récord — por ejemplo, títulos de abogados que, usualmente se obtienen en 5 años, podían obtenerse en menos de 2—. Algunas de las instituciones cerradas eran, por ejemplo, la Universidad Cooperativa de Colombia, la Universidad Autónoma de Quito, la Universidad Pérez Guerrero, entre otras. 

Otra de las decisiones que tomó fue la instauró el Examen Nacional para la Educación Superior (ENES) como mecanismo central de ingreso a las universidades, escuelas politécnicas e institutos técnicos y tecnológicos públicos del país, además del Sistema Nacional de Nivelación y Admisión. Su nombre cambió con el paso de los años —en 2021 se convirtió en Transformar—, pero fue eliminado por el gobierno del presidente Guillermo Lasso. 

Entonces, ¿qué es la Senescyt? 

La Senescyt —que tiene una categoría ministerial— es la institución rectora de las políticas públicas y principios que rigen a la educación superior en Ecuador. Es, además, la entidad que debe promover la investigación científica, la innovación tecnológica y los saberes ancestrales del país. 

Según la visión de la institución, su labor debe enfocarse en mejorar las capacidades y habilidades de la ciudadanía. 

¿Cuáles son las funciones de la institución? 

Las responsabilidades de la Senescyt están contenidas en el artículo 183 de la Ley Orgánica de Educación Superior: 

• Debe establecer mecanismos de coordinación entre la función ejecutiva. Es decir, el gobierno, y el Sistema de Educación Superior.
• La institución tiene que ejercer la rectoría de las políticas públicas de su competencia: educación superior, ciencia, tecnología e innovación. 
• La  Senescyt debe garantizar el cumplimiento de la gratuidad en la educación superior. 
• La entidad, además, debe identificar carreras y programas considerados de interés público y priorizarlas de acuerdo con el plan nacional de desarrollo. 
• La Senescyt debe diseñar, implementar, administrar y coordinar el Sistema Nacional de Información de la Educación Superior y el Sistema de Nivelación y Admisión. 
• La institución debe diseñar, administrar e instrumentar la política de becas del gobierno para la educación superior del país. Para hacerlo debe existir una coordinación constante con el Instituto Ecuatoriano de Crédito Educativo y Becas (IECE).
• La entidad se encarga también de establecer políticas de investigación científica y tecnológica de acuerdo con las necesidades del desarrollo del país, además de  crear los incentivos para que las universidades y escuelas politécnicas puedan desarrollarlas, sin que sus políticas internas se vean comprometidas. 
• La Senescyt debe elaborar informes técnicos para conocimiento y resolución del Consejo de Educación Superior en aquellos casos relacionados a los objetivos del Plan Nacional de Desarrollo. 
• La institución debe hacer informes técnicos que sustenten resoluciones del Consejo de Educación Superior. 

¿Quiénes han liderado a la Senescyt? 

• René Ramírez: El economista asumió la Secretaría en noviembre de 2011, tras su creación. Estuvo frente a la institución hasta 2017. 

• Augusto Barrera: El médico y político asumió la secretaría en mayo de 2017, cuando el ex presidente Lenín Moreno asumió la Presidencia del país. Renunció en agosto de 2018. 

• Adrián Bonilla: El docente asumió su cargo en agosto de 2018. Su renuncia fue aceptada el 29 de junio de 2019. 

• Augusto Albán: El doctor fue designado como secretario el 3 de julio de 2019 por el expresidente Moreno. Salió en abril de 2021. 

• Alejandro Ribadeneira: El ingeniero eléctrico fue designado como secretario de la Senescyt el 26 de abril de 2021. Renunció a su cargo en julio de 2022. 

• Andrea Montalvo:  La psicóloga y magíster en asesoramiento educativo fungió como subsecretaria de la Senescyt desde mayo de 2021 hasta julio de 2022. En ese mes, el presidente Lasso la designó como nueva titular de la Secretaría. En sus primeros días de gestión, se eliminó el examen de acceso de las universidades públicas de educación superior.