La Fiscalía General del Estado, anunció en  su cuenta de Twitter, que la Fiscal General, Diana Salazar formuló cargos contra el asambleísta por Sucumbíos Eliseo Azuero, Jorge Jalil, ex subdirector del Servicio de Contratación de Obras (Secob),  Jean Carlos Benavides, ex asesor de Daniel Mendoza, y 10 personas más por el delito de delincuencia organizada. Un tribunal de la Corte Nacional de Justicia acogió el pedido de la Fiscal. 

En la audiencia instalada en el edificio de la Corte, en Quito, Salazar solicitó prisión preventiva para los 13 procesados, que son investigados por una estructura de corrupción en la construcción del Hospital Básico de Pedernales en la que estaría involucrado, además, el ex asambleísta de Alianza País, Daniel Mendoza. 

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La construcción del hospital empezó el 6 de marzo de 2020. Sin embargo, fue suspendida debido a la crisis sanitaria. El  17 de junio, en su comparecencia ante la Comisión de Fiscalización de la Asamblea Nacional, el Ministro de Transporte y Obras Públicas, Gabriel Martínez, anunció la terminación del contrato para la construcción del hospital de Pedernales, la ciudad más afectada por el terremoto de 2016, cuyo epicentro se dio frente a sus costas.  Martínez dijo, además, que espera concretar el proyecto con el Cuerpo de Ingenieros del Ejército. 

Jean Carlos Benavides, ex asesor del asambleísta Mendoza, fue detenido el 15 de mayo de 2020 en Portoviejo. Tenía 1,6 millones de dólares entre efectivo y cheques sin cobrar de una cuenta del consorcio Pedernales-Manabí, que estaba encargado de la construcción del hospital básico. Benavides cumple prisión preventiva desde entonces. 

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El ex asambleísta de Alianza País, Daniel Mendoza y el ex director del Secob, Edmundo Tamayo, también son procesados por este caso. El 6 de junio, el juez Marco Rodríguez, dictó prisión preventiva para ambos, además prohibió la enajenación de sus bienes y exigió la retención de sus bienes. Mendoza renunció a su curul legislativo el 1 de julio de 2020.

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El 13 de julio pasado, la Fiscalía pidió vincular al asambleísta de la Bancada de Integración Nacional, Eliseo Azuero, a la instrucción fiscal por delincuencia organizada tras encontrar un supuesto audio entre él y Daniel Mendoza. Azuero negó la existencia de ese audio. Jorge Jalil, subdirector del Secob hasta junio de 2020, es uno de varios ex funcionarios del servicio de contratación estatal  involucrados en el caso de corrupción en el hospital de Pedernales.