Carlos Luis Morales, prefecto de la provincia del Guayas, usará un grillete electrónico que monitoreará sus movimientos, no podrá salir del país y deberá presentarse periódicamente frente a la autoridad, sin embargo, no se especificó a cuál. El prefecto de la provincia más afectada por el covid-19 es investigado por el presunto delito de tráfico de influencias en la compra de insumos médicos realizados por su prefectura.

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La audiencia de formulación de cargos en su contra y siete personas más, entre ellas están los supuestos accionistas, gerentes y propietarios de las empresas vinculadas en los presuntos delitos de peculado por la adquisición de insumos médicos con sobreprecio. Sin embargo, son más de ocho personas las que están siendo investigadas, incluyendo a la esposa del prefecto, su exesposo y su hijo. Esta se instaló la noche del 3 de junio de 2020 en la Corte Provincial de Justicia de Guayaquil. La Fiscalía solicitó a Ismael Figueroa, Juez de Garantías Penales, que dicte prisión preventiva contra las ocho personas detenidas. Pero al igual que en la audiencia del expresidente Abdalá Bucaram, el juez no aceptó el pedido de la Fiscalía y dispuso otras medidas cautelares distintas a la prisión preventiva

El prefecto del Guayas tiene la prohibición de salida del país, debe presentarse periódicamente  ante la autoridad y usar el dispositivo de vigilancia electrónico o grillete electrónico.

A los funcionarios detenidos en el caso de la Prefectura guayasense, la Fiscalía los investiga por denuncias por presuntos sobreprecios en la compra  de 5 mil unidades de pruebas rápidas de covid-19, 70 mil mascarillas KN95 y guantes quirúrgicos. 

Según un comunicado de la Fiscalía, Yanina Villagómez, fiscal provincial de Guayas, presentó la información extraída del Servicio de Rentas Internas (SRI) y de la Superintendencia de Compañías, el informe de investigaciones, con los que pudo determinar la existencia de irregularidades en el proceso de adquisición de mascarillas y pruebas rápidas para detectar covid-19 a presunto sobreprecio. 

Los contratos de compra presentados durante la audiencia, fueron suscritos por el Gobierno Autónomo Provincial del Guayas (el nombre oficial de la Prefectura) con personas naturales y empresas que estarían relacionadas con Morales y de acuerdo a la Fiscalía, “varias compañías están en estado pasivo y los domicilios que constan en los contratos serían fachadas”. 

 El martes 2 de junio, Carlos Luis Morales dijo que había presentado una denuncia para investigar a varias personas como presuntos involucrados en irregularidades de la adjudicación de contratos durante la emergencia sanitaria. Entre estas personas ,se encontraban los dos hijos de su esposa, pero se deslindó de la responsabilidad personal en el proceso.

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La fiscal Villagómez, en una rueda de prensa realizada el 3 de junio dijo que en “el caso de peculado que se investiga en el hospital del IESS (Teodoro Maldonado Carbo) bordea los 12 millones de dólares”. La Fiscalía allanó el edificio de la Prefectura del Guayas el 27 de mayo de 2020, en el allanamiento, la Fiscalía incautó catorce computadores de escritorio con el CPU y documentación.