La noche del 15 de enero de 2021, el pleno del Consejo Nacional Electoral (CNE) aprobó el cambio de color de las papeletas del binomio presidencial. En la nueva impresión, las papeletas serán de color verde, en vez del color lila que fueron impresas anteriormente pero tuvieron un error en la impresión del logotipo de una de las organizaciones políticas. 

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El 13 de enero de 2021 el CNE informó que 6 millones de papeletas del binomio presidencial fueron impresas con un error y serán destruidas. El logotipo de la organización política AMIGO no estaba y en su lugar estaba impreso el antiguo logotipo de la organización MEJOR EC, nombre con el que se inscribió la organización en 2019 cuando pidió la clave al CNE para iniciar la recolección de firmas para inscribirse como movimiento nacional. 

Sin embargo, el 16 enero de 2020 cuando el CNE recibió el acta de fundación del movimiento aún estaba registrada como MEJOR EC y el 21 de enero de 2020 cambiaron el nombre a AMIGO. 

Los candidatos de AMIGO, son Pedro Freile, analista político y experto en contratación pública y Byron Solís, un Ingeniero Financiero, según la página web de la Senescyt. Freile dijo en redes sociales que el error era un “grave perjuicio” a la organización política, a la ciudadanía y al país. 

En una publicación de Twitter, Diana Atamaint, presidenta del CNE, dijo que el cambio se hizo para “garantizar absoluta transparencia en las elecciones del 7 de febrero”. En un comunicado el CNE, dice también que el cambio de color servirá para evitar especulaciones sobre el uso de las papeletas anteriores. 

Atamaint dijo que han comenzado un análisis sobre el error de impresión para aplicar las sanciones a los funcionarios de las áreas de verificación, de control de calidad y diseño de papeletas electorales, “que tienen que responder al país y a esta institución”. La presidenta Atamaint dijo que los funcionarios responsables fueron separados del CNE. 

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Las elecciones generales se realizarán el 7 de febrero de 2021, en caso que haya segunda vuelta, el CNE estableció que se realice el 11 de abril de 2021.  El Instituto Geográfico Militar es la entidad encargada de la impresión de las papeletas electorales. En las bodegas del instituto se clasifican las papeletas de acuerdo al número de electores de cada Junta Receptora del Voto para ser enviadas al centro de acopio y que luego se armen los paquetes electorales para enviar a todas las provincias y circunscripciones del exterior.