El caso Secom tiene su primer fallo. Los jueces de la Corte Nacional de Justicia, Daniela Camacho e Iván León, determinaron este 12 de octubre de 2020 la inexistencia del delito de peculado en el caso. De esta manera, se declara la inocencia de los cuatro procesados—entre los que estaba Fernando Alvarado, exsecretario de comunicación del gobierno de Rafael Correa.

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El tercer integrante del tribunal penal, el juez Iván Saquicela, discrepó con Camacho y León, y sostuvo en un voto salvado que sí existe responsabilidad por parte de los implicados en el delito de malversación de fondos públicos. Además de Alvarado, también estaban involucrados en el caso Pablo Yánez y Galo Pacheco, exsubsecretarios de Comunicación, y Carlos Bravo, directivo de la empresa Gota Azul que era proveedora de la Secretaría de Comunicación (Secom)— que estaba adscrita a la Presidencia de la República.

En marzo de 2019, la Fiscal General de ese entonces, Ruth Palacios, acusó a Alvarado, Yánez, Pacheco y Bravo de haber utilizado fondos públicos para fines personales. La Fiscalía investigaba un posible delito de peculado— cuando un funcionario público abusa, se apropia o dispone de bienes y recursos que están bajo su control— en la contratación de servicios de comunicación en la Secom.

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Según la Contraloría General del Estado, desde la Secom Fernando Alvarado contrataba, con fondos públicos, productos de comunicación para atacar a opositores del gobierno de Rafael Correa. Alvarado fue secretario de esta institución desde junio de 2013 hasta noviembre de 2015. 

En agosto de 2018, Alvarado recibió tres medidas cautelares — prohibición de salida del país, presentación cada 15 días ante el presidente de la Corte de Justicia del Guayas, y el uso de grillete electrónico. Sin embargo, dos meses después, en octubre, el exsecretario de la Secom se despojó del grillete y huyó del país

La jueza nacional, Sylvia Sánchez ordenó prisión preventiva en su contra y pidió notificar a la Policía Nacional y a la Interpol para su captura. Desde entonces, Alvarado se encuentra prófugo de la justicia, presuntamente en Venezuela, según su cuenta personal en Twitter.  

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La Fiscalía General del Estado dijo en su cuenta de Twitter que apelará el fallo que declaró como inexistente el delito por el que Alvarado era procesado.