El Consejo Nacional Electoral (CNE) ofreció disculpas públicas a la población trans por haber distribuido a los electores por su sexo y no por su género. El sexo está determinado por las características biológicas —masculinas o femeninas— y el género por las características sociales y culturales más allá de la biología —incluye a los transexuales y a las personas no binarias, personas que nacieron con un sexo biológico determinado pero se identifican con el otro género o con ninguno de ellos. El anuncio se realizó a través de un comunicado en su cuenta de Twitter el 12 de septiembre. 

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El error del CNE provocó que las personas que cambiaron su género ante el Registro Civil hayan sido asignadas a juntas receptoras del voto para las elecciones de febrero de 2021 que no coincidían con su identidad de género.

Además, el CNE dijo que solicitará al Consejo Nacional de Igualdad de Género y otras instituciones para que brinden capacitaciones al personal del organismo electoral para que comprendan “las diferencias entre sexo y género”.

Las disculpas a la población trans se ofreció después de que varias organizaciones denunciaran el error. Una de ellas fue el colectivo Revolución Trans. A través de una carta, la organización dijo que varias personas trans, al consultar su lugar de votación, notaron que la junta receptora del voto que les asignaron era contraria a la del género que les correspondía.

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Organizaciones como el Consejo Nacional para la Igualdad de Género se pronunciaron por el error de la asignación de juntas receptoras de acuerdo al género. El Consejo dijo, a través de un comunicado, que establecer las juntas receptoras del voto conforme al sexo y no al género de las personas trans “constituye menoscabo a sus derechos a la identidad de género e igualdad y no discriminación reconocidos” en la Constitución  “y en múltiples instrumentos internacionales de derechos humanos”. Además, exhortó al organismo electoral a corregir su error. 

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Según un comunicado del CNE, el error ya fue corregido y puede ser visto en el sitio web de la institución: www.cne.gob.ec. Además, se habilitó un correo electrónico secretariageneral@cne.gob.ec para consultas.

Con la aprobación de la Ley de Gestión de la Identidad y Datos Civiles en 2016, las personas transgénero pueden sustituir el campo sexo por el de género en su cédula de identidad. Como resultado de la aprobación de esta ley,  las personas trans pudieron votar en la junta receptora que corresponde a su género en las elecciones de 2017 y 2019.