El proyecto Mirador está en una zona de alta biodiversidad. Según el Observatorio de Conflictos Mineros de América Latina (OCMAL), Mirador queda a mil metros de altura en la Cordillera del Cóndor, considerada por el Ministerio de Ambiente como un área protegida.
La Cordillera del Cóndor alberga a 16 ecosistemas diferentes. En ellos viven cuatro mil especies de plantas, y entre 300 y 400 especies de algas, según La revisión crítica parcial del Estudio de Impacto Ambiental para la Fase de Beneficio del Proyecto Minero de Cobre Mirador realizada por William Sacher, profesor de la Universidad Andina Simón Bolívar y especialista en Hidrología.